課程資訊
課程名稱
族群健康中的基因學與醫學
Genetics and Medicine in Population Health 
開課學期
110-1 
授課對象
公共衛生學院  公共衛生學系  
授課教師
盧子彬 
課號
EPM5028 
課程識別碼
849 U0560 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二6,7(13:20~15:10) 
上課地點
公衛210 
備註
與黃其晟合授
總人數上限:25人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1101EPM5028_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程主旨在於介紹基因與醫學在族群健康中的重要性,近年來隨著高通量基因體研究技術發展,不同層次的基因分子被廣泛研究,內容包含單核甘酸多型性、拷貝數、甲基化以及基因表現數值等等,均在個體及族群層次上被證明是重要的影響因子。近年來世界各國的大型人體資料庫也將基因數據做為重要的收集資料,因此在公共衛生的研究上基因已是不可或缺的一部分。本課程將由不同層次的基因分子生物意義介紹起始,期待透過這些內容讓學生對於分析各式基因數據前能理解這些分子在細胞與個體上的重要性,接著會透過研究實例與分析操作讓學生接觸實際實驗測量產生之數據,以期能讓學生體會真實研究進行之狀況。課程後段則將介紹目前在醫院上可使用的基因檢測相關工具,讓學生能夠感受基因資料在實務上的重要性,以期讓生物理論與實務應用可以緊密結合。

This course aims to introduce the importance of genetics and medicine in population health. Recently, with the advancements in high-throughput genetics technologies, different genetic molecules, including single nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), methylation and gene expression, have been intensively studied and reported as important factors affecting individual and population health. Furthermore, many counties have included genetic data into their large-scale biobanks and thus genetics has become an essential component in public health researches. In this course, we will first introduce the functions and mechanism of different genetic molecules in order to let students have better understanding of the biological roles of these molecules. Next, we will provide research examples and computer practices to let students become more familiar with real data. Lastly, we will introduce currently available genetic testing tools in the real world to let students understand what genetics can do nowadays.
 

課程目標
訓練學生了解各式基因相關分子之生物意義,接觸實驗數據以具備基本分析能力,進而能針對不同研究議題選擇合適的基因分子主題

This course aims to provide better understanding of biological meaning of different genetic molecules. In addition, students must undergo real data analyses during the course and thus they should have the ability to choose appropriate genetic molecules for further investigations in different research topics.
 
課程要求
R程式語言撰寫及基礎生物學能力 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. David W. Mount (Author) 
參考書目
Genetics: Analysis of Genes and Genomes 9th Edition. Daniel L. Hartl (Author),
Bruce Cochrane (Author)  
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期末報告 
35% 
 
2. 
期中報告 
35% 
 
3. 
課程參與 
10% 
 
4. 
作業 
20% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
09/28  課程介紹及基因單核甘酸多型性 / Introduction
and DNA single nucleotide polymorphism (SNP) 
第2週
10/05  基因表現(I) / RNA gene expression (I) 
第3週
10/12  基因表現(II) / RNA gene expression (II) 
第4週
10/19  甲基化 / DNA methylation 
第5週
10/26  拷貝數 / DNA copy number 
第6週
11/02  非編碼核糖核酸 / Noncoding RNAs 
第7週
11/09  腸道菌 / Metagenomics 
第8週
11/16  預後與預測:癌症的個人化醫療 / Prediction and prognosis : Personalized treatment of cancer patients (黃其晟教授) 
第9週
11/23  基因表現公有數據庫介紹 / Introduction of public datasets of gene expression (黃其晟教授) 
第10週
11/30  基因功能富集分析 / Gene set enrichment analysis (黃其晟教授) 
第11週
12/07  消失的遺傳性:全基因組關聯分析/ Missing heritability : GWAS (黃其晟教授) 
第12週
12/14  次世代定序簡介:原理與判讀 / Introduction of next-generation sequencing : theory and applications (黃其晟教授) 
第13週
12/21  公有數據庫與個人基因數據之整合組學 / Public databases and integrated analyses of individual level (黃其晟教授) 
第14週
12/28  癌症基因體學及檢測工具應用 / Cancer genomics and genetics testing applications (黃其晟教授) 
第15週
2022/01/04  期末報告 (I) / Final Report (I) 
第16週
2022/01/11  期末報告 (II) / Final Report (II) (黃其晟教授) 
第17週
2022/01/11  彈性教學 -> 研究實例分享 
第18週
2022/01/11  彈性教學 -> 臨床實驗分享 (黃其晟教授)